第二代试管是在第一代试管的基础上进行改进的。第二代试管只有在第一代试管失败后才能完成。较好将成功的胚胎自然结合起来。只有精子和卵子不能自然结合，患者才能做第二代试管。女性的不孕基本上可以在第一代试管期间得到很好的治疗，而第一代试管的失败表明这可能是男性的精子问题，因此可以使用第二代试管来帮助解决男性的不孕问题。如果直接做第二代，女性的不孕问题就无法解决，最终会影响胚胎的质量，降低胚胎的成功率。
不同的患者适合不同的试管方案。有些病人适合第一代试管，有些病人适合第二代试管。然而，为了更好地提高成功率，第二代试管通常需要先制作第一代试管。以下是不直接制作第二个试管的原因和缺点分析：
1. 女性的子宫环境是胚胎植入的关键。做第一代试管可以治疗女性不孕，如输卵管问题、内分泌问题、宫腔问题等。直接做第二代女性的问题不能完全解决，最终很有可能导致试管失败；
2. 第一代试管失败后，医生会根据失败的原因进行分析，可以清楚地了解男性是否有问题。男性问题导致的失败需要用第二代试管来解决。如果直接做第二代试管，虽然可以治疗男性不孕症，但女性的一些隐藏性基本上会被忽视，最终可能会产生异常甚至流产；
3. 第二代试管是在第一代的基础上发展起来的。第一代试管自然授精的妊娠成功率会比较高。失败后，医生会采取措施解决问题，直接采用第二代试管技术。妊娠成功的概率取决于男性精液的质量。如果男性精液质量差，成功的概率会很低。
在医院做第二代试管之前，患者通常会先做第一代试管，但在做第一代试管之前，尽量不要做第二代试管，因为第二代试管的精子没有适者生存，胚胎的妊娠率会低于第一代。