二代试管婴儿和一代试管婴儿的费用差别不怎么大，一般二代会比一代贵2万左右。第一代试管婴儿适应人群为因排卵障碍导致不孕的女性，可以帮助卵子和精子在体外结合形成受精卵，费用大概在3-5万左右，第二代试管婴儿适应症包括男性精子异常引起的男性不育，在一代的基础上增加了单精子卵胞浆内注射术，费用大概在5-8万元左右。
对于第一代试管婴儿，主要有促排卵、促排卵、取精、体外受精、胚胎培养、胚胎移植、剩余胚胎保存等步骤，不同夫妻情况不同，费用差别主要在促排卵、取精、体外受精过程，不同的促排卵方案往往费用相差较大。如超长方案、长方案用药时间较长，药量较大，费用较高；拮抗剂方案、微刺激方案用药时间较短、药量较少，费用相对较低，不同女性之间单项促排卵费用相差可在1万-3万元。取精方式不同费用也不同，如果能自然排精，则费用较少，如果需要做睾丸穿刺取精，还会增加3000元左右的手术费用，总体费用在2万-5万元。
对于第二代试管婴儿，主要过程和费用跟第一代基本相似，主要区别在于体外受精方式，即卵胞浆内单精子注射技术，费用在3000元左右，在促排方案和取精方式一样的情况下，比第一代多3000元左右的费用，总体费用与第一代试管婴儿相差不大，也是2万-5万元。
不同的试管治疗方案费用不同，二代试管因为增加了精子注射技术，相对来说费用会比一代高，但是差不也不是特别大，患者可以根据自己的实际情况选择合适自己的治疗方案。
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