由药物的副作用影响生育者，称为药源性不孕症。据统计，4～6的不孕是由药物引起的。
磺胺药复方新诺明常用于治疗尿路感染、呼吸道感染、扁桃体炎等。它在生育方面的副作用是抑止睾丸功能，使精子数量大为减少，精子活动能力明显低下。柳氮磺胺吡啶是用于治疗溃疡性结肠炎的药物，也能导致精液缺乏，使精子异常者达80，同时伴有精子数量减少，精子活力降低和不育。
抗生素呋喃西林及其衍生物会抑止睾丸细胞碳水化合物的代谢和氧耗，使生精细胞中的DHA浓度下降，引起精子减少，导致不育。大环内酯药物，如红霉素、螺旋霉素、麦迪霉素等，会造成精子发育停顿和有丝分裂减少，使精子被杀伤或被杀死，存活的精子活动力也明显下降。
甲氰咪呱此药用于治疗十二指肠溃疡，大量持续使用时可引起精子数量减少而致不育。有报道，每日口服1200毫克，9周后精子数可减少43。
激素类长期应用过量的类固醇激素，可抑止男性下丘脑-垂体-睾丸轴功能，使睾丸萎缩，精子生成减少，导致不育。这种情况在长期服用类固醇激素的男运动员中已得到了证实。应用雌激素可使男性出现阳痿、射精延迟和不能射精，即使能射精亦只有很少的精液量。使用肾上腺皮质激素可使女性发生月经不调、闭经，雄性激素可以使女性出现月经推迟、性欲亢进和男性化。
镇静安眠药长期使用或滥用巴比妥和非巴比妥类镇静安眠药，可使女性出现月经失调和排卵障碍，男性可出现性欲下降、阳痿或性高潮丧失。氯丙嗪对神经系统各个节段均有作用，例如对丘脑下部具有增加催乳素，抑止促性腺激素的分泌，导致雌激素和睾丸素分泌减少。
抗高血压药利血平是治疗高血压的常用药物，可使组织中的儿茶酚胺耗竭而产生显著的镇静作用，从而间接地降低性欲。长期使用抗高血压药会影响丘脑下部的垂体功能，从而抑止了精子的产生。
麻醉和镇痛药吗啡、杜冷丁、海洛因等能干扰下丘脑垂体系统的调节过程，使阴茎不能勃起或勃起不坚，以致不能完成性交过程，造成射精障碍，导致不育。
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