基因筛选对女性不会有痛苦，因为基因筛选一般都是通过生化检测、DNA分析以及染色体分析进行的，而这些检查的检验物都是来源于羊水、血液或者胎儿细胞、染色体等等。另外，对于不同时期的胚胎活检有不同的优点和缺点。当然，第三代试管婴儿技术，其进行筛选主要针对染色体结构异常和有明确的基因诊断的单基因疾病。
正常情况下，基因筛选一般都是通过生化检测、DNA分析以及染色体分析进行的。其中生化检测可以通过检测羊水、尿液、血液以及羊膜细胞样本确定是否存在基因缺陷，而做DNA分析识别异常基因，分析的细胞主要来源于血液或胎儿细胞。至于染色体分析是直接对染色体结构以及数目进行分析检测，观察胎儿是否存在异常。所以和试管女性本身并没有直接影响，不会造成痛苦。
试管基因筛选的具体情况第三代试管婴儿在胚胎移植之前会进行遗传学基因检测，也就是胚胎植入前遗传诊断，运用的是PGD技术。女性体检之后，排卵之后，可以对极体进行活检，但是这个时候只能检测母源性的基因突变，不能够检测父源性的基因突变。还可以检测结合成受精卵发育到第三天的卵裂球胚胎，第五天的囊胚期的滋养外胚层的细胞。不同时期的胚胎活检有不同的优点和缺点，应该根据自身的情况和医生的建议，选择合适的阶段的胚胎进行活检。通过检测能够判断胚胎染色体基因中是否携带单基因遗传病。
第三代试管基因筛选的种类1.染色体结构异常
常见的是染色体平衡易位，罗氏易位，还有染色体倒位。此类染色体结构异常的疾病可通过第三代试管婴儿技术将其筛查并剔除，保证产儿健康。
2.有明确基因诊断的单基因疾病
有明确基因诊断的单基因疾病可被第三代试管婴儿技术筛查出，如影响男性无精子或严重少精子的Y染色体微缺失，这类女性也可以通过三代试管婴儿技术选择女性胚胎，从而阻断遗传学异常的传递。
总之，基因筛选对女性不会有痛苦，因为基因筛选一般都是通过生化检测、DNA分析以及染色体分析进行的，而这些检查的检验物都是来源于羊水、血液或者胎儿细胞、染色体等等。
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