三代试管目前主要会通过精液密度梯度离心法、上游法筛选出健康活跃的精子。精液密度梯度离心法就是利用多层Percoll，对精子进行优化，在离心30分钟后就活动力强的精子穿过整个Percoll。而上游法就是将精液混匀后加入离心管中，然后加入培养液，孵育1小时后，吸取上层培养液并稀释，然后再离心5分钟，去除清液即可获得质量较高的精子。除此之外，还有简单洗涤法，就是直接离心，收集沉淀的精子团。
对于精子浓度和活动率大致正常的精液，可采用直接上游法，但在精子症严重少、弱或畸形的情况下，比较好采用密度梯度离心法，因为可以回收更多的活动精子。
1、直接上游法
直接上游法利用精子自身的运动能力将活动精子从精液中分离出来，可以获得活动性好的精子，更适合活动精子百分比高的精液标本。
2、密度梯度离心法。
密度梯度离心最常用的方法是由的上层和的下层组成的两层密度梯度离心液。精子通过活性精子的运动能力和各种细胞的密度差来分离，使精子在试管底部形成软沉淀，可获得优质精子，无白细胞、不成熟生殖细胞等污染。与简单的上游方法相比，操作更容易标准化，精子回收率更高。常用于制备IVF/ICSI精液标本。
这两种方法是生殖医学领域的主流精液处理方法，能有效去除精液中的杂质和细菌，筛选出优质精子。选择哪种精子取决于精液样品的质量。
三代试管婴儿洗涤之后的精子与卵子结合形成受精卵，再用PGD/PGS筛查技术，对受精卵培育成的囊胚进行检测，在双重筛选的保护下，确保移植入子宫的是健康胚胎。
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