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经直肠超声主要用于那些精液检查提示射精管末端完全梗阻的患者，即射精，无精子，pH值低，无果糖等。患者至少有一侧输精管可被触及，激素检查结果常为正常。射精管末端部分梗阻的患者也应进行经直肠超声检查，这些患者表现为射精量少、少弱精子症（数量少，活力低）和（或）射精痛等。与输精管完全性梗阻相比，部分性输精管梗阻的患者精液中果糖含量为正常低限，物理性状及激素水平没有明显异常经直肠超声基础。经直肠超声的原理与其他超声检查方法一致。超声波由探头发出，反射波经电脑处理后转变为图像。图像质量主要决定于探头发射的声波频率。探头频率越高，图像质量越高，但组织穿透力也越低。经直肠检查方式所检查的组织深度有限，所以检查者可以使用较高频率的双平面探头，虽然该频率低于检查阴囊和阴茎的浅表超声探头，但由于十分接近前列腺，所以能够清晰表现输精管和精囊等结构的细微解剖特征。

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