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手术后的妊娠率如下：轻度粘连的75％妊娠，中度粘连的62％妊娠，严重粘连的42.1％妊娠，广泛子宫内膜异位症者有50％妊娠。关于为改善子宫内膜异位症生育力而进行手术治疗时腹腔镜手术时机的问题仍有争论。实际上，在许多患者中由于这一疾病的进展性，结合大量前瞻性随机试验表明手术时进行治疗可以改善生育力，似乎对于微小和轻度子宫内膜异位的患者在腔镜手术时进行子宫内膜异位灶的切除是明智之举。由于还没有前瞻性的随机研究，我们还不能就关于通过腔镜治疗进展性子宫内膜异位是否可以改善生殖结局得出结论，但实际上，我们没有理由那么悲观。因此，如果像一些研究者宣称的那样，患有子宫内膜异位症和异位囊肿的患者她们在生殖的多方面都被削弱的话，那么可以通过手术使之恢复正常。814例患有子宫内膜异位囊肿的患者腹腔镜手术后有50％的人成功妊娠也支持。原因可能是由于子宫内膜异位囊肿的破坏和切除不仅简单地恢复了盆腔解剖和卵巢结构，可能还有更深层次的原因。
子宫内膜异位组织中芳香酶的表达和局部雌激素分泌在子宫内膜异位发展中的重要作用暗示了芳香酶抑制剂在子宫内膜异位相关不孕症中的有益作用。抑制子宫内膜着床处的局部雌激素分泌以及抑制芳香酶以刺激卵巢从而降低外周雌激素水平，这被认为可能可以防止子宫内膜异位发展，并改善这一类女性的辅助生殖结果。此想法仍待经过临床试验验证。多囊卵巢综合征患有的女性在辅助生殖期间发生并发症的风险很大，尤其是容易发生严重卵巢过度刺激综合征。如之前讨论，这类女性可以通过抑制芳香酶从而降低雌激素水平，并可能减少发生严重的风险。有趣的是，在这类患者中抑制芳香酶可在子宫内膜水平起作用。已证明雌激素可通过刺激雌激素受体泛索化降低其自身受体的水平，这将导致受体快速降解在不存在雌激素的情况下，泛素化减弱从而上调雌激素受体水平．并增加后续雌激素给药的敏感性。这能增加子宫内膜对雌激素的反应，使子宫内膜上皮和基质的生长速度加快，并改善流至子宫和子宫内膜的血流情况。最后，尽管在芳香酶抑制剂治疗周期观测到较低的雌激素水平，但子宫内膜可正常发育。
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