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核染色质异常的检测,染色体非整倍体的检测在第一或第二次减数分裂中期,会发生染色体不分离,导致精子含有异常染色体组。荧光原位杂交( FISH)可以方便地在精子细胞分裂间期评估染色体倍数,有研究显示人类精子染色体非整倍体的发生率远高于其他生物。设计针对特定染色体相对较大片段(通常0.2~2Mb)的特殊荧光探针,当探针与精子样本杂交后,在荧光显微镜下可见被标记的染色体部分在精子头部呈现荧光区域。多种探针技术能对不同的染色体组合进行检测,可以区分单一染体的二体性和二倍体。由于人眼区分颜色差异的局限性,一次仅能使用3~4种不同探针进行分析严重少、弱和(或)畸形精子症患者的精子具有较高的非整倍体率,这可能就是造成其WHO精子参数异常的原因。有证据表明在受精或胚胎第一次细胞分裂时缺少预防非整倍体的选择机制。但是尚不清楚非整倍体精子增加到何种程度后会对辅助生殖和自然生育造成不利影响。