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克罗米芬在下丘脑、垂体和其他部位的雌激素受体结合作为雌二醇的竞争性拮抗剂发挥作用。下丘脑弓状核部位雌激素受体的阻断导致促性腺激素释放激素的分泌增加进而增加（可能还有）脉冲频率而不是脉冲幅度。此外，克罗米芬还可以通过类似雌激素的作用方式增加垂体对的敏感性。这些作用的结果是，在克罗米芬给药期间，分泌的血清浓度增加3~4倍。上升的刺激卵泡生长，而刺激留体合成。与促性腺激素周期不同，克罗米芬周期更容易促使单卵泡发育，由于在卵泡期雌二醇的负反馈使下调而削弱了多卵泡发育作用。由于克罗米芬为雌激素拮抗剂，克罗米芬诱发排卵时要求有完整的下丘脑﹣垂体﹣卵巢轴和雌激素。由于它的作用部位，克罗米芬的每日剂量必须一次性服用，以使其优先进入下丘脑和中枢神经系统的受体部位。

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另外，所报道的实验方法之间有很多的差异，这些差异不仅包括pH值，还包括了细胞裂解液的组成、电泳的条件，以及采用新的染色质染料。一旦彗星形成，可以采用不同的软件程序进行不同方法的测量。最后，结果报告的形式也不同：一些实验室计算精子形成彗星的百分比，另外的实验室报道一定数量精子DNA迁移的平均水平。因此，该方法依然在逐步改进，且缺少标准化，导致不同实验室之间的结果很难比较。精子核基质分析有两种检测方法可以归为细胞核基质分析。精子核基质稳定性分析与精子染色质扩散试验建立在脱掉染色质蛋白未受损伤的DNA能够环绕在精子核骨架这一基础之上。已经发表的文献显示核基质蛋白种系之间的突变能够导致DNA修复和染色质浓集缺陷，因此基质的病变能够损害生育力，应当作为将来考虑的内容之一。