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虽然该项检测特异性高，但它需要密切关注其严格的评分标准，以保证检测的准确性并减少检验员之间的变异。目前为止，无法自动化操作限制了应用该技术在辅助生殖医学中进行相关研究的数量。精子核DNA损伤的检测已经研发了一些用于评估精子染色质完整性的检测用法，它们评估男性生育力的检测效能正被广泛研究。总的来讲，所有检测方法可以分为三类：①精子染色质结构探针；②精子DNA碎片直接评估；③精子核基质的检测。另外，还有其他一些不常用的方法，如高效液相色谱法。减少DNA扭曲产生的能量。该类型染料与松散DNA的嵌合力较低，与变性的和碎片化的DNA不结合。在这种情况下，将染料结合到DNA磷酸化残基的外部机制和聚合型染料受到青睐（异染性：AO聚合体结合到DNA呈现红色荧光）。20世纪60年代以来就已知碎裂的DNA易于变性。
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