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染色质包装密度苯胺蓝（aniline blue , AB）染色显示DNA包装异常的精子核染色质蛋白更易于同酸性染料结合。精子酸性AB着色（蓝色）增加表明染色质包装松散。同时也提示因过多的组氨酸残留造成和蛋白更易于被碱性基团结合。这种大颗粒的染料无法同正常精子（核蛋白主要为鱼精蛋白成分）中包装致密的染色质结合。酸性AB对精子核蛋白的评价结果与AO实验具有良好的一致性（90)，而且其结果所反映的异常染色质精子数量与男性不育之间具有明确的相关性。但是AB﹣染色精子的百分率与其他精液参数之间的关系依然存在争议。其中一个重要的发现就是，苯胺蓝染色显示的染色质浓集水平是IVF结局一个较好的预测指标，但是它不能反映ICSI后的受精潜能、卵裂情况和妊娠率。染色质蛋白与AO实验相似，染色质结构分析（SCSATM )主要对AO染色的绿色荧光（自然的DNA）向红色荧光（变性的或松散的DNA或RNA发生异染性转变进行定量，在原位检测精子核DNA对酸诱导构象转变的易感程度。
也就是说，如果精子在到达输卵管后卵子还没有到来，那么精子就只能在这里等待卵子。而寿命较短的Y精子是禁不起这种等待的，也许还没等到卵子的到来，Y精子就已经死去大部分了。那么在卵子到来的时候，就会出现X精子比Y精子更多的情况，剩下的Y精子也会因为大限将至而失去了活力。在这种情况下，Y精子显然是争不过X精子的。所以说，精子在输卵管中等待的时间越长，对Y精子就越为不利。比较好的性交时机应该是在排卵前后，此时Y精子还很强壮，而且占有数量上的优势，因此很容易与卵子结合生成男胎。
越来越多的证据表明外源性因素在特发性少、弱、畸形精子症的发病机制中具有重要作用。不良生活方式、营养失衡、抽烟、久坐、肥胖等都已经证明可以损伤精子质量。职业和（或）环境毒素暴露也具有关键性作用，如工作环境中可能存在重金属、操作间高温和化学污染等。但是，通过食物、饮水和空气暴露于扰乱激素分泌的因素被认为是过去四五十年世界的一些区域男性精液质量持续减退同时睾丸癌发病率增加的主要原因。人工合成的具有雌激素样作用的物质被称作外源性或假性雌激素，包括杀虫剂（DDT )、多氯联苯、氧化呋喃类、二嚼英、苯二甲酸盐、羟基苯甲酸酯类、乙基雌二醇等。这些制剂很难降解，且在环境中和人体内具有生物累积效应。它们不与性激素结合球蛋白结合，在胎盘内不发生代谢，可以自由进入胎儿体内。鉴于此，外源性雌激素可以损害胎儿的睾丸发育，导致胚胎细胞在生殖上皮内持续存在，这些细胞可以蜕变导致睾丸癌（43:44）并能够阻碍Sertoli细胞分裂和成熟，造成以后罹患少精子症。这些雌激系仔章"物同样能够在FSH水平正常的成年少精子症患者中抑制下丘脑﹣垂体轴的功能。激素干扰物，尤其是杀虫剂。可以导致严重的氧化负载而损伤精子细胞膜和DNA。
1.引起炎症时，大量白细胞消耗精液中存在的能量物质，降低精子活力，缩短其存活时间，精子数量减少，质量降低；
2.引起宫颈炎时，会改变粘液性质和量，影响精子活力和进入数量，即使侥幸存活也不易顺利通过宫颈进入宫腔；
3.引起子宫内膜炎时，改变了子宫内的正常环境，即使侥幸存活的精子与卵子结合成为受精卵，也不能在子宫内着床发育；
4.引起输卵管炎及盆腔炎时，导致伞端闭锁或输卵管粘膜破坏时输卵管闭塞，影响输卵管运送精子、捡拾卵子及将受精卵运送到宫腔的功能。
