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另外，所报道的实验方法之间有很多的差异，这些差异不仅包括pH值，还包括了细胞裂解液的组成、电泳的条件，以及采用新的染色质染料。一旦彗星形成，可以采用不同的软件程序进行不同方法的测量。最后，结果报告的形式也不同：一些实验室计算精子形成彗星的百分比，另外的实验室报道一定数量精子DNA迁移的平均水平。因此，该方法依然在逐步改进，且缺少标准化，导致不同实验室之间的结果很难比较。精子核基质分析有两种检测方法可以归为细胞核基质分析。精子核基质稳定性分析与精子染色质扩散试验建立在脱掉染色质蛋白未受损伤的DNA能够环绕在精子核骨架这一基础之上。已经发表的文献显示核基质蛋白种系之间的突变能够导致DNA修复和染色质浓集缺陷，因此基质的病变能够损害生育力，应当作为将来考虑的内容之一。
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