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染色质包装密度苯胺蓝（aniline blue , AB）染色显示DNA包装异常的精子核染色质蛋白更易于同酸性染料结合。精子酸性AB着色（蓝色）增加表明染色质包装松散。同时也提示因过多的组氨酸残留造成和蛋白更易于被碱性基团结合。这种大颗粒的染料无法同正常精子（核蛋白主要为鱼精蛋白成分）中包装致密的染色质结合。酸性AB对精子核蛋白的评价结果与AO实验具有良好的一致性（90)，而且其结果所反映的异常染色质精子数量与男性不育之间具有明确的相关性。但是AB﹣染色精子的百分率与其他精液参数之间的关系依然存在争议。其中一个重要的发现就是，苯胺蓝染色显示的染色质浓集水平是IVF结局一个较好的预测指标，但是它不能反映ICSI后的受精潜能、卵裂情况和妊娠率。染色质蛋白与AO实验相似，染色质结构分析（SCSATM )主要对AO染色的绿色荧光（自然的DNA）向红色荧光（变性的或松散的DNA或RNA发生异染性转变进行定量，在原位检测精子核DNA对酸诱导构象转变的易感程度。
