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AO染色的显微镜分析法,采用酸化固定剂使细胞核变性后用荧光显微镜观察,而不再需要流式细胞仪,当然,AO染色后是可以联合流式细胞仪进行分析的。有研究显示正常生育力男性和不育男性精子AO染色结果具有显著性差异。反映男性自然生育力的正常染色质百分率的"分界值"为80%~50%(绿色荧光)。如果精子含有过多的单链DNA( ssDNA ),检测时仅有较少量绿色荧光(<50%),则会对常规IVF受精产生不利影响。但是与ICSI的妊娠率和活产率没有关联,不含有单链DNA精子的患者,其妊娠率最高。甲苯胺蓝是另一个用于染色质正染和异染的碱性核染料,它能够大量地掺入到致密染色质中,属于针对DNA结构和包装敏感的结构探针。具有完整染色质的精子头部能够染成淡蓝色。核异常的精子(头部染成紫色的精子)与AO染色方法中头部染成橘黄色精子在计数结果上是一致的。

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