囊胚移植和鲜胚移植在试管婴儿技术中是不同的过程，主要存在以下区别：性质不同：鲜胚是指精子和卵子结合之后，受精卵经过多次分裂，成为多个细胞组成的胚胎，胚胎的形状好像桑椹。而囊胚是鲜胚经过一段时间的发育，形成一个中空的细胞球，这个具有空腔的胚胎就可称之为囊胚。
移植时间不同：鲜胚移植一般是在取出卵后第3-5天进行。而囊胚移植则是将鲜胚在体外养至第6-7天时，形成外胚层与内胚层后，再进行移植。
成功率不同：鲜胚是在卵子和精子结合之后形成的受精卵，一般是在体外培育3天左右进行移植，进入子宫后还会继续游走。而囊胚移植要有良好质量的囊胚，医生选择质量较好的囊胚进行体内移植，通常不会游走，容易着床。因此相对条件而言，囊胚移植的成功率会高于鲜胚移植。
