试管婴儿也可能存在一些遗传缺陷。然而并非所有试管婴儿都会出现这种情况，因为遗传缺陷并不完全取决于生育方式。
遗传因素
在试管受精过程中，胚胎可能被检测出携带某种基因突变或异常，这可能导致一些遗传性疾病的发生。即使在进行基因筛查后，仍然无法排除所有风险。此外父母本身存在的遗传问题也是一个重要因素，在选择本人或免费精者时需要格外注意。
环境因素
除了遗传原因外，环境因素也可能对试管婴儿的健康产生影响。例如在怀孕期间暴露于有害物质、营养不良或其他不良习惯（如吸烟、酗酒等）都可能增加宝宝出现缺陷的风险。
医学进步
随着医学技术的不断进步和完善，越来越多的先进检测方法被应用于试管婴儿过程中，以减少患病风险。例如PGD（Preimplantation Genetic Diagnosis）技术可以在胚胎移植前检测染色体异常或遗传疾病，从而提高健康婴儿的诞生率。
