盆腔结核引起不孕的主要原因之一是其对生殖器官的直接影响。结核病菌侵袭盆腔器官，导致器官组织的破坏和粘连，使子宫、输卵管、卵巢等器官功能受损，影响受精卵的着床和胚胎的发育。这种破坏和变形使得怀孕变得异常困难。此外，盆腔结核还可能引发盆腔积液，增加了子宫内膜异位症的发生率，进一步加重了不孕症状。
另一个导致不孕的因素是盆腔结核对女性生殖系统的免疫反应。结核杆菌引发的炎症会激活免疫系统，导致局部和全身性的免疫反应增加。这种免疫反应可能导致免疫性不孕，即免疫系统攻击精子或受精卵，阻止受精或着床。这会增加怀孕失败的风险，使不孕症状更加严重。
除了直接影响生殖器官和免疫系统外，盆腔结核还可能影响女性的内分泌系统，从而导致不孕。结核病菌侵袭盆腔器官会干扰内分泌腺体的正常功能，导致雌激素和孕激素水平失衡。这种内分泌紊乱可能影响卵巢排卵的正常过程，造成排卵障碍和月经周期紊乱，进而导致不孕。
盆腔结核患者常常伴有全身情况的恶化，例如体重下降、贫血、乏力等。这些全身症状可能影响女性的身体状况，降低体质素质，进而影响怀孕的可能性。特别是贫血可能导致子宫内膜供血不足，影响着床和胚胎的发育。
盆腔结核治疗过程中所采用的药物，如抗结核药物和激素，也可能对不孕产生影响。一些抗结核药物具有肝毒性和肾毒性，长期使用可能损伤肝肾功能，影响体内药物代谢和排泄，进而影响生殖器官的功能。此外，激素治疗可能干扰内分泌系统的平衡，加重不孕症状。