试管婴儿保存胚胎移植相比于新鲜胚胎移植具有一些优势。新鲜胚胎需要在体外培养一段时间后进行移植，而这个过程可能会导致一部分囊胚发育不良或者无法存活。而通过将优质囊胚进行保存，能够避免这个问题，并且可以选择最佳时机进行移植。在一定程度上提高了着床成功率。
试管婴儿保存胚胎移植也有可能增加着床成功率。在新鲜周期中，子宫内膜可能尚未达到最佳状态就需要进行移植。而通过使用控制性超排卵和保存胚胎移植的方法，可以将子宫内膜的准备时间延长，使其更加适合囊胚着床。这样可以提高囊胚在子宫内膜上的着床率。
并非所有保存胚胎移植都能够成功。成功率受到多种因素的影响，包括女方年龄、子宫内膜状态、囊胚质量等。年龄是最主要的影响因素之一，随着年龄的增加，女性自身生育能力逐渐下降，对于试管婴儿来说也是如此。此外，如果子宫内膜不够厚或者存在其他问题，也可能导致着床失败。此外，在选择囊胚时需要注意其品质，优质的囊胚更容易成功着床。