三代试管成功后可能会导致儿童出生时体重偏低。研究表明，通过辅助生殖技术获得的胚胎在发育过程中可能受到影响，从而导致出生时体重较轻。这种情况可能增加婴儿出现早产、低血糖和呼吸困难等并发症的风险。
三代试管成功后的儿童可能面临着更高的患病风险。一项研究发现，在通过辅助生殖技术诞生的孩子中，存在着更高的心血管疾病、高血压、糖尿病和癌症等患病风险。这可能是由于胚胎在试管中的发育环境与自然受孕时的环境存在差异导致某些基因表达方式的改变。
三代试管成功后的儿童还可能面临心理和社交问题。辅助生殖技术可能会对儿童的身份认同、家庭关系和亲子关系产生影响。有研究发现，通过三代试管获得的孩子更容易感到与其他人不同，并面临着对自己生物渊源的好奇和困惑。这可能对他们的心理健康和社交能力造成一定程度上的影响。
三代试管成功后还有一些其他潜在风险需要考虑。例如，在移植过程中使用抗生素或其他药物可能会对妈妈和胚胎产生副作用。此外，在体外受精过程中也存在着卵巢过刺、输卵管积液等并发症的风险。