嵌合体囊胚移植后，虽然是不会自动修复，但是有可能生出健康宝宝的。嵌合体囊胚属于染色体有问题，在囊胚嵌合的比例越大时，在移植后失败的概率就会越大，就算移植成功宝宝出生后患病的概率也会越大。所以一般检测出嵌合体问题的囊胚，医生是不会建议患者进行移植的，除非患者已无其余可移植胚胎，且患者家庭已明确知道嵌合体囊胚移植后的风险，并签订相关知情同意书后，医生才会移植符合标准的嵌合体囊胚。
嵌合体囊胚移植后，胚胎是不可能会自动修复成功的，但是却有可能会生出健康胎儿。嵌合体囊胚是指包含两种以及两种不同的染色体成分的细胞系，由于分裂当中染色体分离错误而导致的。这种染色体异常的囊胚移植后是不会自动修复，因为嵌合体囊胚属于正常胚胎，也属于不正常胚胎，所以也是有机会生出健康宝宝的。
移植的囊胚是嵌合体宝宝生出来可能正常，嵌合体胚胎指的是胚胎的细胞中有两种及以上不同的染色体组成，是一种染色体异常状态，移植后容易出现流产、胎停的情况，但嵌合体胚胎发育过程中也有可能自行淘汰染色体异常的细胞，发育成染色体正常健康的胎儿，有的嵌合体生出的宝宝会表现出严重的异常，在孕中期一定要进行羊水穿刺，检查胎儿的染色体，避免宝宝出生缺陷。