公立医院建档做nt检查免费还是自费由地方决定，有些地方的公立医院是免费的，有些地方的公立医院则是收费的，毕竟nt检查不是属于全国免费，大部分地区还是需要自费，比如广东、北京等地区做nt就是免费的。
虽然有部分地区的公立医院做nt检查免费，但不代表每个家庭在当地做都能不自费，想要免费就要满足当地的相关政策条件，才能获得免费资格，而且不同地区的条件还有所差别，这里以广东距离，在公立医院建档做nt免费条件如下：
1、在深圳的广东省户籍孕妇或者持有效广东省居住证的孕妇；
2、符合再生育政策的，按规定每孩次可以继续享受一次免费孕前优生健康检查服务；
3、持广东省居住证登记结婚人员，可以继续享受一次免费孕前优生健康检查服务；
4、凡是深圳出生的新生儿，不符合上述免费服务条件，依旧能享受减免政策；
5、不是所有医院都是免费的，一定要前往定点服务机构即可享受免费筛查服务。
值得一提的是，大部分妇幼保健院做nt的时候是没有免费的，有些医院需要单独测量nt，收费大概在50～100元之间。有些医院开展早孕期胎儿系统B超，在测量nt以及普通胎儿超声指标的同时，也会检测胎儿是否存在三尖瓣返流静脉以及静脉导管反流等，花费大概在300元左右。