39岁高龄女性基础卵泡较少可以做第三代试管。39岁高龄女性虽然基础卵泡较少，但质量比数量更为重要，通过三代试管技术医生会选取出最优质的卵子，采用体外受精和胚胎培育技术，同时选择最健康的胚胎进行移植，以此来提高受孕率。
39岁是女性生育能力急剧下降的阶段，卵子质量和数量的减少会显著影响受孕率和胚胎质量，基础卵泡较少可能面临一些生殖健康挑战，但仍然可以考虑第三代试管婴儿技术，主要原因包括：
1、弥补自然受孕不足： 随着年龄增长，女性卵巢功能逐渐衰退，卵子质量和数量减少。试管婴儿技术可以通过体外受精、胚胎培育和移植，弥补自然受孕可能的不足;
2、提高受孕几率： 对于卵泡较少的39岁高龄女性，试管婴儿技术可以通过选择质量较好的卵子，提高受孕几率;
3、胚胎质量评估： 在试管婴儿过程中，可以对受精卵进行质量评估，选择质量较好的胚胎进行移植，增加妊娠成功的可能性;
4、个性化治疗方案： 医生可以根据患者的具体情况制定个性化的治疗方案，调整药物使用剂量和治疗时机，提高受孕几率;
5、技术不断进步： 随着医疗技术的不断发展，试管婴儿技术的成功率不断提高，对于卵泡较少的女性也提供了更多的机会。