试管婴儿嵌合体胚胎移植3个月后，也依旧是有一定风险的，可能会在自己体内内发生异常，比如说死胎、流产、胎停育等等，还有可能会出现胎儿畸形的情况。同时也可能会生长发育落后，智力低下，因此成功后要定期产检，若发生异常，就要及时在医生建议下终止妊娠。
移植的囊胚是嵌合体宝宝生出来可能正常，嵌合体胚胎指的是胚胎的细胞中有两种及以上不同的染色体组成，是一种染色体异常状态，移植后容易出现流产、胎停的情况，但嵌合体胚胎发育过程中也有可能自行淘汰染色体异常的细胞，发育成染色体正常健康的胎儿，有的嵌合体生出的宝宝会表现出严重的异常，在孕中期一定要进行羊水穿刺，检查胎儿的染色体，避免宝宝出生缺陷。
嵌合体胚胎是一种染色体异常表现，移植囊胚是嵌合体有可能宝宝生出来不是正常的，囊胚嵌合体在后续发育中可能会出现以下几种情况，例如一是发育成胎儿的细胞是正常的，胚胎可以继续发育，获得健康宝宝，二是染色体异常的细胞出现在发育成胎儿的内细胞团中，移植后胚胎不能正常发育，出现流产或胎儿畸形的情况，三是大部分细胞染色体异常会导致胚胎不能发育成健康宝宝。