男性患有乙肝是可以做三代试管婴儿来避免遗传的。乙肝的病毒复制率高、传染性强，这种情况就会导致染色体异常，影响成功率，这个时候可以通过三代试管婴儿，在移植前进行胚胎染色体筛查，挑选出健康的胚胎进行移植，进而降低下一代感染乙肝的可能，实现优生优育的目的。
第三代试管婴儿能有效阻断后代患乙肝的可能。乙肝不是遗传性疾病，主要就是家族性传播，母婴垂直传播，母亲如果是乙肝E抗原阳性，所生子女未注射乙肝疫苗，大都成为乙肝病毒携带。在试管前会对男性女性双方进行血液检查，检查体内是否带有乙肝病毒。所以，经过检查是能够筛查出孩子方是否携带有乙肝病毒的。
对于乙肝准爸爸来说，试管婴儿通过第三代试管婴儿精子洗涤技术，洗去精液中的乙肝病毒，从而获取健康精子，再结合女性健康的卵子，才会形成受精卵，接着培养成胚胎，移植到女性子宫体内，通过10月份的妊娠，获得自己的健康宝宝。