三代试管移植后，胚胎也有可能会出现生化。造成这种现象的原因是多方面的，如子宫内膜环境差、自己体内的环境或第三代试管技术检测不全等，因此，利用三代试管技术辅助怀孕的不孕不育患者，需要积极配合医生做相应的检查，尤其是一些致畸检查，有利于胎儿在子宫内健康生长发育。
虽然第三代试管筛选胚胎，可以大大提高移植的成功率，但是生化和胎停还是有可能发生。总的来说，第三代试管是一种先进的试管技术，但并不意味着不会发生胚胎停止，因为胎儿的生长发育与很多原因有关。胚胎的质量，子宫内膜的状况，激素都会影响胎儿的生长。
目前第三代试管技术不太会导致胎儿出现生化妊娠或胎停育的现象，但还是有一定的可能性的，只是可能性比自然受孕小很多，因为三代试管对胚胎要求高，胚胎质量比较高，试管的成功率自然就高。另外，导致生化妊娠或胎停育的原因有很多，比较常见的原因主要包括女性子宫异常、生活作息不规律。