三代试管成功怀孕后胚胎发育不好的情况也是存在的，但是相对来说比较少，因为在移植前都会对胚胎进行染色体和基因的筛查，筛选出有异常的胚胎，移植健康的胚胎到女性的宫腔内，进而提高试管婴儿的成功率。这种情况出现胚胎发育不好的几率就比较低，所以大家不用太过担心，当然也要做好胚胎发育不好的心理准备。
即便是做三代试管婴儿也可能会出现胚胎畸形的，因为胚胎在生长发育过程中可能会受到外界因素的影响，如环境污染，从而导致胎儿畸形。怀孕后，应定期到医院进行产前检查，如唐氏筛查、四维彩色多普勒超声等，以排除胎儿畸形的可能性。
试管移植后，与自然受孕一样，也会有胚胎发育不良，出现胎停育的现象，这时需要及时终止妊娠。胚胎发育不良的原因有染色体异常、内分泌异常、营养不良、卵子和精子本身质量不好以及子宫发育畸形等情况。建议大家在移植后多吃一些有营养的食物，不要去有污染的环境，避免影响胚胎发育。