三代试管婴儿容易胎停育可能是由于女性年龄增长导致卵巢功能下降，影响卵子质量。随着年龄增长，女性的卵子数量和质量都会逐渐下降，使得受精卵发育不良或出现染色体异常的情况增加。
在试管婴儿过程中使用的激素药物也可能对胚胎产生不良影响，导致胚胎发育异常或者无法顺利着床。这些药物在调节女性月经周期和促进卵泡生长的同时也可能会对子宫内膜的准备和营养给予造成影响。
患有一些基因缺陷或遗传疾病的夫妇做试管婴儿也有可能导致胚胎发育异常而引起胎停育。这些基因缺陷可能来自于父母双方，通过遗传方式传递给后代，在试管受精过程中可能会显现出来。
还有一种可能是由于孕酮水平不稳定引起的。孕酮是一种重要的孕激素，在怀孕初期能够维持子宫内膜厚度和稳定胚胎着床，但如果孕酮水平不足或波动较大，则可能导致子宫环境不适合胚胎生长发育而造成流产。
心理压力也是一个重要因素。怀孕本身就是一个需要心理健康支持的过程，在经历了多次失败后很容易对自身产生怀疑和焦虑，进而影响到身体内分泌系统和免疫系统功能，并间接影响到试管婴儿的成功率。