北京没有可以做第三代试管婴儿的私立医院。截至2025年6月，根据国家卫健委发布的获准开展辅助生殖技术并设立人类精子库的医疗机构名单，北京有两家民营医院可以做试管婴儿，分别是北京恩德云医院和北京嘉园医院。不过北京有三家公立医院可以做第三代试管婴儿，比如北医三院、解放军总医院第六医学中心、解放军总医院第一医学中心。
1、北京大学第三医院
北医三院生殖医学中心是中国大陆首例试管婴儿的诞生地。近三年门诊人次1796368，完成新鲜体外受精周期52472个。是全国首批生殖医学临床培训基地，先后诞生了mainland China第一、第二个试管婴儿、第一个怀孕试管婴儿、第一个保存胚胎试管婴儿、世界第二个试管婴儿、中国第一个“三冻”试管婴儿。
2、解放军总医院第六医疗中心
解放军总医院第六医学中心开展了多项人类辅助生殖技术，与国际先进的妊娠辅助机构——悉尼体外受精中心建立了技术交流与合作，开展了体外受精-胚胎移植(IVF)、卵胞浆内精子显微注射、囊胚培养与移植、胚胎玻璃化保存等技术。
3、解放军总医院第一医学中心
中国人民解放军总医院(301医院)始建于1953年，是一所集医疗、保健、教学、科研为一体的大型现代化综合性医院。海军总医院辅助生殖医学中心是在全军计划生育优生技术中心的基础上建立的。国家卫生部备案批准的试管婴儿手术单位，是专门为不孕不育患者进行诊断和辅助妊娠治疗的机构。