染色体异常也可能发生在第三代试管单角子宫培养优质囊胚时。临床上，专家对胚胎等级的判断主要分为生长速度、胚胎形态和细胞中的胚胎碎片三个方面，在判断胚胎等级的过程中没有筛选出染色体，因此即使是高质量的囊胚也可能有染色体异常。为避免这种情况，患者可选择第三代试管技术对囊胚染色体进行筛查，降低囊胚带染色体异常移植的概率。
染色体异常的概率是相同的，无论是高质量的囊胚还是普通的囊胚，因为在判断胚胎水平时不会筛选染色体，所以高质量的囊胚不可能没有染色体异常。以下是高质量囊胚染色体异常的原因：
1.如果配偶任何一方有染色体异常，卵子和精子都会携带异常基因，形成优质囊胚后会出现染色体异常；
2.如果夫妻在日常生活中经常接触各种化学物质或辐射，可能会导致精子和卵子的基因突变和染色体畸变；
3.随着女性年龄的增长，卵巢功能也会下降，卵子可能会发生许多衰老变化，影响同源染色体在成熟分裂中的关系和后期分裂的作用，导致染色体不分离，导致染色体异常。
一般来说，高质量囊胚中会出现染色体异常，出现的概率也很高。建议有上述条件的家庭在怀孕前进行体检。如有染色体异常，可通过三代试管筛选技术选择正常染色体胚胎进行移植，确保胚胎正常，生下健康的婴儿。