在保存的过程中，胚胎受到一定程度的冻伤是难以避免的。虽然现代保存技术已经相当先进，但仍然存在一定的风险，尤其是对于长时间保存的胚胎来说。这可能导致某些基因突变或细胞损伤。
胚胎的质量也可能会受到影响。长时间的保存可能导致细胞结构的改变，从而影响胚胎的健康和发育。即使胚胎成功解冻，其发育和implantation的能力也可能会受到影响，增加了出现问题的风险。
研究表明，长时间保存的胚胎在移植后其着床率和妊娠率可能会降低。这意味着即使胚胎成功存活并被植入，也可能面临着较低的成功率，增加了多次移植的可能性，从而增加了整个过程的风险和成本。
保存胚胎的年龄也是一个重要因素。年龄越大的胚胎，其质量和健康状况可能会受到更大的影响。长时间保存的胚胎，尤其是年龄较大的胚胎，可能会面临更高的风险，包括出现染色体异常等问题。
也有研究表明，保存胚胎的质量和健康状况与保存的时间并不一定成正比。有些胚胎可能会在长时间的保存后仍然保持良好的状态，成功发育为健康的婴儿。并不是所有保存胚胎都会出现问题，但风险仍然存在，需要慎重考虑。