一般来说，男方出现染色体平衡易位的夫妻有自怀成功的几率，但成功率极低，且自怀成功以后胚胎出现异常的概率又极高，在这种情况的自然怀孕且生下健康婴儿的概率还不足1%。所以大部分有染色体平衡易位问题的人群都会选择做三代试管助孕，对胚胎进行基因筛选以后再进行移植，能降低胚胎因染色体异常而停育、流产、畸形的概率。
染色体平衡易位是一种有怀孕概率的染色体异常，通常在女方怀孕期间不会出现异常，但流产的可能性非常高，这导致染色体平衡易位患者自然怀孕的可能性非常低。因为平衡易位的患者仅有1/18是正常的胚胎，1/18的胚胎是与父母双方相同的平衡易位胚胎，另外16/18的胚胎则是异常胚胎，这就意味着选择自怀的患者可能会面临多次胎儿停育造成的生化或流产，严重危害女性的身体健康，虽然有成功怀孕的案例，但几率极低。
即使选择做三代试管助孕，染色体平衡易位的患者的成功率也偏低。因为染色体异常，配出的胚胎只有不到6%是正常胚胎，所以一般都需要大量的胚胎才能够筛选出正常的胚胎，而得到大量囊胚的概率又较低。所以染色体平衡易位的患者进行三代试管，可能需要反复、多次的促排卵，才可能够得到正常的胚胎，开销相对来说比较大。但若患者不进行三代试管而自行备孕，对女性的伤害更大，所以相比之下，大多数染色体平衡易位的夫妻还是会选择三代试管的方式助孕。
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