在台湾进行三代试管婴儿是可行的，台湾在医疗领域具有较高水平的医院和专业团队。然而，选择合适的机构是一个重要的决定，以下是选择机构的几个关键因素：

1. 医院的资质和信誉：选择具有合法执业资质、好评较多且信誉良好的医院，这有助于确保医院具备一定的专业能力和治疗水准。

2. 医生的经验和专业水平：考虑医生的经验和专业水平，包括对三代试管婴儿的专业知识和技术的熟悉程度。医生的经验和专业背景对成功率和治疗效果至关重要。

3. 医疗设备和技术：医院拥有先进的医疗设备和技术，对于三代试管婴儿的操作和实验室环境有重要影响。确保医院设备先进，支持安全、准确和高效的试管婴儿操作和培养。

4. 患者评价和口碑：参考其他患者对医院的评价和口碑，了解其服务质量和患者满意度。可以通过在线论坛、社交媒体或患者评价网站等途径获取相关信息。

5. 费用和支付方式：了解医院的收费标准、费用结构以及医保报销情况，确保对费用有清晰的了解。同时，了解医院是否提供合适的支付方式和分期付款选项。

在选择之前，推荐与医生进行详细咨询和面对面的沟通，了解其治疗方案、成功率、风险等，并根据个人情况、需求和预算进行综合评估和决策。请谨慎选择，并在选择机构之前进行充分的研究和咨询，以确保选择到合适的机构和医生。