根据研究表明，引起这种疾病的原因有很多，比如一些宫腔操作手术、分娩、多次流产、经期同房、长期精神压力过大等这些因素都有可能导致巧克力囊肿，身体过度肥胖也是引起巧克力囊肿的一个重要因素。
引起巧克力囊肿主要有以下几种原因：
1、先天性原因：发育器官不正常。
2、内分泌因素。
3、性生活不节制。
4、环境因素：压力过大，影响内分泌的失调，间接引起。
5、一些宫腔操作手术操作不当。
6、分娩、多次流产或经期同房。
7、过度肥胖。
患者是需要及时治疗的，不要拖延，否则会导致继发不孕，此外还要正确合理饮食，多吃高蛋白食物、新鲜的蔬菜和水果等，不要吃辛辣刺激性的食物。
患有巧克力囊肿的女性能否自然怀孕主要视情况而定：
1、如果严重程度比较小，并且没有出现明显痛经的现象，此时自然怀孕的几率跟正常女性是一样的；
2、假如比较大超过了5厘米，此时自然怀孕的几率非常低，必须进行手术治疗。
这不仅仅会引发不孕，还会同时患有其他并发症，而且可能还会有癌变的不可想象的严重后果。因此女性如果患有巧克力囊肿，应该及时进行治疗。目前治疗方法主要有三种：药物治疗、物理治疗以及手术治疗，对于有生育需求的女性来说，建议采取手术治疗，提高怀孕几率。
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