试管婴儿移植囊胚出现畸形的概率和自然妊娠畸形率是一样的，并没有说囊胚移植畸形率高。囊胚移植的试管婴儿尽管也有风险和不确定性，但是基本上出现在多胎妊娠、成功率的上面，畸形的风险不大。本身导致胎儿畸形的因素有很多，像遗传、感染等等，不能单从胚胎来判断。
首先，囊胚移植的试管婴儿并不会比自然受孕的婴儿更容易出现畸形问题，囊胚移植的试管婴儿在出生时的畸形率与自然受孕的婴儿相差不多;其次，囊胚移植的过程中，医生会对囊胚进行严格的筛选，只选择健康的囊胚进行移植，从而降低了畸形的风险;最后，囊胚移植的试管婴儿在出生后也需要接受与自然受孕的婴儿相同的健康检查和监测。如果在检查过程中发现了任何健康问题，医生会及时进行治疗和干预，以确保婴儿的健康和安全。
囊胚移植的风险和不确定性1、可能没有胚胎移植或者冷冻：不是所有胚胎都能在体外发育成囊胚，因此会出现没有胚胎移植或者冷冻的风险，因此胚胎少的患者不建议囊胚培养;
2、囊胚增高了单卵双胎的概率：大量临床数据回顾性分析发现囊胚的单卵双胎概率稍微偏高，会影响母婴安全。可能跟体外培养过长影响透明带硬度从而改变胚胎孵化有关
导致胎儿畸形的异常原因1、遗传因素：常见父母双方隐性、显性遗传疾病，近亲结婚等，可导致胎儿染色体异常，出现唐氏综合征，目前没有治愈方法，且新生儿成活率低;
2、自己体内因素：主要有妊娠高血压、妊娠糖尿病等合并疾病，可引起胎儿发育畸形;或者长期睡姿不当，胎儿宫内缺氧可导致脑部发育异常;
3、外界因素：包括污染气体、X射线、危险物品、烟酒、细菌或病毒感染、重金属等，这些物质可经自己体内吸收后，转运到胎盘，被胎儿摄取后导致胎儿畸形。
总之，囊胚移植是一种趋势，为了母婴安全，国内外越来越提倡单囊胚移植。但是囊胚培养是一把双刃剑，临床医生会根据患者自身情况、胚胎数目和胚胎质量给出不同的建议，但仍需要患者朋友自己平衡利弊，做出适合自己的选择。
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