做三代试管婴儿筛查后大部分生出的宝宝都不会发生基因突变，除非是新发的基因突变。三代试管婴儿可以进行染色体和基因的筛查，选择没有明确致病基因疾病的胚胎进行移植。如果是明确致病基因指征，比如是家族或者是父母有明确的致病基因，如地贫、色盲或者其他的单基因疾病，做三代试管婴儿就可以阻断基因遗传疾病。
基因突变，即基因组DNA分子发生的突然的、可以遗传的变异现象。而三代试管婴儿中的PGS技术，会在胚胎植入前对其进行遗传学筛查，利用PGS技术对胚胎进行染色体数目和结构异常的检测，主要通过检测胚胎的23对染色体结构、数目，通过比对来分析胚胎是否有遗传物质异常。因此，用三代试管婴儿PGS技术筛查胚胎之后，就不会再出现胚胎基因突变的情况了。
由于三代试管婴儿PGS筛查技术，并不能够百分百的保证可以筛查出基因突变的胚胎，若是父母基因里面存在着极为隐秘的疾病基因，那么在前期的筛查中可能会出现没有筛查出来的情况，导致宝宝出生后遗传到不良基因，会生出畸形儿的情况。所以通过三代试管婴儿怀孕的患者，在怀孕之后一定要定期产检，如发现胚胎有问题，需及时询问医生进行治疗或者改善，必要时需终止妊娠，避免对自身造成伤害。
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