有少数的夫妇不管试管婴儿要多少钱，只想要要个健康漂亮的宝宝，但是在进行辅助生殖助孕成功后却又承受流产的打击。试管婴儿治疗后发生早期自然流产的危险因素还不是十分明确，导致自然流产的原因有很多，括胚胎因素、年龄、疾病、子宫粘连、感染、免疫、心理和生理因素等。那试管婴儿流产的主要原因是什么呢？
流产，尤其是早期流产，较大的原因是胚胎的质量问题，的流产可能与此有关。流产时间发生的越早，胚胎本身的质量问题就越严重。如果胚胎染色体混乱无序，胚胎受精后可能不会发生细胞分裂，或在第三天即停止继续发育；相反，胚胎本身染色体若是存在的问题较轻微，胚胎可能就会存活下来，甚至可以在母亲子宫内活到出生。例如21号染色体三体的胚胎，因为21号染色体很小，对胚胎的存活影响没那么大，因此胚胎可以活到出生，成为先天性愚型患儿。所以对于接受辅助生殖助孕的患者来说，流产并不是一件糟糕的事情。至少，流产可以使人类避免严重缺陷患儿的出生。
除了主要与胚胎的染色体有关外，还有大约10的流产是跟免疫有关的。胚胎一半来自母亲，一半来自父亲。它要在母亲的子宫内种植下来并存活，可不是一件容易的事情。因为人体有一套系统保护自己不受外来物质的侵害，我们医学上叫做免疫系统，它只能识别自身产生的物质，遇到外来的物质是要当作敌人一样排除掉的。这样的免疫防护机制避免了我们受到病毒细菌的袭击，使我们能够保持健康。也是因为我们人体自身的免疫功能，我们在输血时只能输跟自己血型相配的血，在器官移植的时候也是经过非常苛刻地配型成功后才能进行。在怀孕的过程中，胚胎有一半染色体来自父亲，它若想在母亲体内生存下来，一定要逃避掉母亲的免疫排斥功能。我们体内有一套精确的机制来协调自己体内在特定的时间和位置可以允许胚胎种植在自己体内子宫内。但是当母亲的免疫系统功能存在问题时，就容易把胚胎像敌人一样排斥掉，这样也会造成胚胎的流产。我们称此类流产为免疫性流产。这是我们在进行助孕的过程中尽量避免的。
另外还有10~15的流产与自己体内的子宫异常有关。例如子宫畸形、子宫纵隔、双子宫、残角子宫或者疤痕子宫等。根据子宫异常的严重程度，流产的时间也不一样。如果问题比较严重，例如胚胎种植在子宫有疤痕的内膜上，可能导致较早期的流产；如果问题不太严重，可能会造成会中晚期流产；如果问题比较轻微，可能会导致早产。有些异常可以通过宫腔镜进行诊断或手术治疗。但是有些问题目前仍然难以解决。
现在知道了流产的原因，我们也就知道了，对于大多数流产，尤其是早期的流产或者胚胎停育，我们是没有必要去保胎的。大部分情况下，是胚胎的染色体存在问题，导致胚胎不能继续生长或者死亡，此时如果进行保胎，可以维持孕囊继续留在子宫内，但是没有实际意义，较后的结局还是流产。但是流产时一定要小心，有的人在停用保胎药物后会自然流产，也有一部分人需要到医院进行药物流产，还有一部分人需要进行人工流产。人工流产较好不要采用无痛人流，以避免在无痛状态下过度刮宫损伤内膜，影响以后的妊娠。
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