试管长方案会比短方案花费更多的药物费用，因为短方案促排卵针一般打10天左右，而长方案促排针需要打45到60天左右。期间短方案的促排针都是比较单一的，而长方案的促排不仅需要打针偶尔还需要服用药物来帮助促排，所以说长方案的药物费用会比短方案更贵。再加上试管所用的促排药物有国内国外之分，价格也是不大相同的，如果选用国外药物，费用可能还会高达几万元。
相对来说长方案比短方案价位高一些，但是一般来说长方案的成功率高，比较好去医院进行检查，结合医生选择合适的方案，这样比较安全。两个方案的区别具体如下：
适合年龄小、卵巢功能好的患者，时间虽然较长一些，不过促排卵效果、卵巢反应都比较好；长方案是在前次月经的第21天开始使用GnRHa，28天左右血激素值达标，然后开始使用促排卵药，时间大约10天左右，卵泡成熟后注射HCG，36小时之后**；3-5天后进行胚胎移植，同时支持黄体功能，移植后14天左右可到医院抽血检查是否怀孕，整个过程下来通常在45天左右；当然，由于个人体质不同，时间也会有所偏差。
适合年龄大、卵巢功能差的患者，因为卵巢功能较差，如果选择长方案的话，会担心无法将卵泡促起，所以短方案会作为长方案的一种后备方案使用，短方案在月经开始的第二天便可以开始进行，根据医生的建议开始使用促排用药，通常在第10天左右，卵泡生长至直径17-18mm，方可在36小时后进行**。
通常情况下，试管婴儿长方案促排卵之后卵子的数量比短方案要多，培养出优质胚胎的几率也会较大一些，优质胚胎有利于胚胎成功的着床，从而提高试管婴儿的成功几率，但是也并不是所有患者都适合采用长方案，具体还需要根据女性的年龄、卵巢功能情况来进行衡量，适合自己情况的方案最后的成功几率也才是最高的。
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