巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现，对生育影响很大。医生对于巧克力囊肿的处理方式是不一样的，妇科医生担心巧克力囊肿恶变，一般会建议通过手术切除囊肿。但生殖科医生对巧克力囊肿的处理方式会保守一点，因为怀孕本身就是一种对子宫内膜异位症的治疗。
子宫内膜异位症就是子宫内膜异位到子宫以外其他的地方，随着每次月经，除了子宫内膜脱落出血，异位的内膜也会出血，会造成局部的一些炎症反应。子宫内膜异位到卵巢上，就叫巧克力囊肿，异位到盆腔输卵管周围，就会引起输卵管周围粘连。
发病的时间越长，病情就越重，所以有巧克力囊肿的患者要早生宝宝，因为随着病越来越重，怀孕会越来越难。
为什么不赞成手术切除巧克力囊肿?因为手术切除巧克力囊肿不代表以后不会再长，巧克力囊肿很有可能会复发，手术解决不了根本问题。再高明的医生在手术剥离囊肿的时候也会带走一部分卵巢的皮质，造成卵巢功能下降。
在临床曾经看到，两侧卵巢剥离过的巧克力囊肿的患者，年龄不大，卵巢功能已经很差了。因此，如果发现自己有巧克力囊肿的已婚女性，尽早计划怀孕生宝宝，在怀孕的这10个月中异位的内膜不会再出血，对此病是一个好的治疗方式。
如果巧囊较小，可以尽早试管，小于3-4cm的巧克力囊肿，在医师的详细指导下就可以进行试管，怀孕自身就会对巧克力囊肿有必定的医治成效。怀孕后子宫内膜是不会脱落出血的，巧克力囊肿就会逐渐的萎缩掉。而且一般我们试管医生会在取的时候一并处理掉囊肿。如果囊肿较大。建议先行治疗后，再进周试管。
总而言之，巧囊患者能否通过试管**，主要是看看卵巢功能衰退损害程度，如果卵巢功能急剧衰退，卵巢已经无法正常排卵，那么通过试管婴儿也是没办法怀孕，但可以通过合法**等方式来实现生宝宝的愿望。
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