中医科及中医学教研室拥有首批国医大师李济仁教授。1981年成为国务院首批批准具有硕士学位授予权的七个《内经》专业硕士点之一，至今已为培养了硕士研究生四十余名。同时科内还有已故中医本草文献医生尚志钧教授。尚老在校订本草领域方面做出了巨大贡献。学科创科时拥有病房，开设床位18张。2009年10月成立“国医大师”工作室。 学科现有医、教、研人员7人，其中教授、主任医师1人，教授1人，主任医师、副教授1人，副教授、副主任医师1人，医师3人。 教学方面：中医学教研室拥有素质较高的教师队伍，每年承担着研究生、本科、专科、教育等多层次、多系别、多班级的理论课及临床带教的教学任务，每年完成研究生和本科生教学300余学时。 科研方面：已完成省、厅级科研课题及成果15项，获省级自然科学奖和科技进步奖4项、厅级自然科学奖和科技进步奖6项、华东地区及安徽省科技图书奖4项，目前在研项目有与北京科学院、清华大学合作的自然科学基金核心项目一项、学院中青年科研基金项目二项、教学研究项目五项。出版著作45部，如：《济仁医录》、《百年百名中医临床家》、《新修本草》、《本草人生》等，在发表学术论文480余篇。 特别是在“新安医学”及新安医家诊疗经验的研究上卓有贡献。主编的《新安名医考》对新安医家进行了系统的挖掘整理，在此基础上主持的“新安名医考证研究”获1994年安徽省高校科技进步二等奖，1997年安徽省自然科学三等奖，首届医史文献图书及医学工具书银奖。主持的安徽省核心项目“新安医家治疗急危难病症经验的研究”初次系统挖掘、提炼新安医家治疗急危难病症的基本特色与规律，并主编出版了《大医精要—新安医学研究》一书，该成果获2000年安徽省高校科技进步二等奖，2002年安徽省科学技术三等奖。主编的《新安医籍丛刊》获第九届华东六省一市科技图书一等奖。
