由于医院、检查项目和个人情况的不同，在深圳进行妊娠检查并建立孕妇保健手册(俗称“建卡”)的具体费用也有所不同。一般来说，整个怀孕期间的检查费用，包括第一次建卡时的基本检查费用，可能在1000元到2000元之间。这部分费用主要包括血常规、尿常规、肝肾功能、血糖、乙肝、梅毒筛查、艾滋病毒抗体检测、地中海贫血筛查等一系列必要的孕期检查项目。

对于第一次建卡时的基本检查，一些社区医院或公立医院可能会根据政策给予一定的优惠或补贴，以减轻宝妈妈的经济负担。举例来说，在深圳，符合条件的孕妇可以在指定的医疗机构享受免费的地贫筛查服务。此外，根据深圳的医疗保险政策，参加深圳社会医疗保险的孕妇可以通过医疗保险报销在指定医疗机构进行产前检查的部分费用。如果选择在私立医院进行孕期检查和建卡，费用会比较高，但同时也能享受到更个性化、更方便的服务。

为保证母婴安全健康，建议孕妇选择正规医疗机构进行孕期检查，并根据自身实际情况合理安排检查项目。选择医院时，可以提前咨询相关费用，了解是否符合医保报销条件，做好充分准备。同时，还可以关注当地卫生部门发布的相关政策信息，了解是否有适合自己的优惠政策或补贴项目。

简而言之，在深圳建立怀孕卡和检查的成本并不是固定的，它受到各种因素的影响。因此，具体金额也需要根据个人选择的医院和检查项目来确定。建议提前制定计划，并根据自己的需要选择合适的医疗机构进行怀孕期间的健康管理。