第三代试管婴儿在日本进行（PGT，也就是说，胚胎植入前的遗传学检测）的成本将根据不同的诊所、治疗方案和个人情况而有所不同。一般来说，整个过程可能涉及以下主要成本部分：

1. 初步检查费用:夫妻双方都需要进行一系列体检，以确定是否适合试管婴儿技术。这部分费用通常在几万日元到几十万日元之间。

2. 促排卵药物费用：女性需要使用促排卵药物，以获得多个卵子用于体外受精。由于药物类型和个人反应不同，这部分费用约为几十万日元。

3. **手术及实验室手术费用：**手术加上后续精子处理及胚胎培养等实验室工作，费用约为几十万至一百万日元。

4. PGT检测费:这是第三代试管婴儿的核心环节，旨在筛选出无遗传疾病的胚胎。PGT检测费用通常较高，一般在100万日元到200万日元左右。

5. 胚胎移植费：将经PGT检测确认的健康胚胎移植回母体子宫，这一步的费用约为几十万日元。

6. 其他额外费用：除上述基本项目外，还可能产生一些额外费用，如冷冻未使用的胚胎、黄体支持药物等，具体金额取决于情况。

考虑到上述成本，日本第三代试管婴儿的总成本约为300万至500万日元。当然，实际价格需要结合具体情况，直接咨询当地专业医疗机构获取更准确的信息。此外，考虑到成功率不是100%，有时成功怀孕可能需要多次尝试，这意味着总成本可能会进一步增加。因此，在决定接受治疗之前，建议与医生充分沟通，并制定财务计划。