关于三代试管婴儿能否申请深圳社保，首先要明确几个关键点。首先，深圳的社会保障体系包括基本医疗保险、工伤保险、生育保险等。对于想要三代试管婴儿技术的家庭来说，最关心的可能是生育保险和基本医疗保险的相关政策。

三代试管婴儿技术（PGT-Prenatal Genetic Testing），主要用于向下一代预防遗传性疾病，具有较高的医疗价值。在经济发达、注重民生保障的深圳，辅助生殖技术的支持政策相对完善。但是，部分费用能否通过社会保障报销，取决于当地的具体政策法规。

根据现行政策，深圳市人力资源和社会保障局对生育保险的规定没有明确将第三代试管婴儿纳入报销范围。这意味着，如果家庭选择进行第三代试管婴儿手术，在大多数情况下，他们可能需要自费承担相关费用。然而，随着社会的进步和医学的发展，未来政策调整的可能性并不排除。

此外，即使第三代试管婴儿不在生育保险报销范围内，一些检查项目或治疗过程中的某些环节也可能享受基本医疗保险待遇。例如，在进入第三代试管婴儿的正式周期之前，夫妻通常需要接受一系列全面的体检来评估他们的身体状况和生育能力，这可能被基本的医疗保险覆盖。

值得注意的是，虽然深圳目前的社会保障政策可能不涵盖第三代体外受精技术本身，但还有其他方式可以为合格的家庭提供一定的支持。例如，一些慈善机构或基金会可能会为经济困难的家庭提供资金；此外，政府还可能会引入相应的补贴措施来减轻特定群体的经济负担。

综上所述，目前深圳社会保障体系对三代试管婴儿技术的支持主要体现在部分检查项目的报销上，核心手术费用需要自行支付。当然，随着社会的发展和科技的进步，相关政策将不断调整和完善。因此，建议密切关注官方信息，咨询专业人士获取最新信息。同时，鼓励合格家庭积极寻求各种资源和支持，以更好地应对相关挑战。